IRADIASI BERKAS ELEKTRON PADA CORONAVIRUS BARU (COVID-19)

Posted by goresan refleksi on Sunday, June 28, 2020 in Teknologi Sains | No comments

 

 

karakteristik interaksi berkas elektron iradiasi dengan coronavirus baru (COVID-19) melalui simulasi numerik Monte Carlo dan juga peran mekanika kuantum dalam menangani pandemi COVID-19. Model fisik COVID-19 dibangun berdasarkan urutan gen yang terdeteksi dari pasien Wuhan dari Pusat Informasi Bioteknologi Nasional (NCBI). Interaksi termasuk hamburan elastis dan inelastik antara elektron teriradiasi dan molekul RNA / protein dihitung dengan mode Mott dan Rutherford. Karakteristik elektron internal dan distribusi eksitasi disimulasikan. Untuk lebih memahami dampak iradiasi E-beam pada setiap bagian COVID-19, perlu menganalisis kehilangan energi di setiap area. Selanjutnya, variasi kehilangan energi di setiap daerah dalam situasi yang berbeda dari energi kejadian diselidiki untuk menunjukkan sensitivitas energi pada COVID-19.

Karena coronavirus novel (COVID-19) memiliki banyak jenis fungsi protein di sekitarnya, untuk kelayakan perhitungan, di sini kami memilih tiga jenis terutama protein ketika membangun model fisik dengan penyederhanaan yang cukup masuk akal. Mirip dengan coronavirus lain yang ditemukan seperti SARS dan MERS, coronavirus novel (COVID-19) pertama kali dikelilingi oleh beberapa glikoprotein lonjakan yang jarang seperti yang ditunjukkan pada Gambar. 1. Kemudian, di bawah glikoprotein lonjakan, ada lebih dari satu lapisan protein amplop. Meskipun masih ada sebagian kecil dari hemagglutinin di daerah ini untuk membantu memadukan virus ke sel, dalam model fisik kami, kami memilih protein selubung utama sebagai perwakilannya.

Di dalam coronavirus baru, nukleokapsid menempel erat RNA, keduanya berkeliaran di dalam virus bersama dengan ruang celah. Mempertimbangkan kompleksitas struktur ruang RNA dan keacakan gerakan RNA, maka dalam model fisik kita, kita dapat memperlakukannya sebagai nukleokapsid yang mengelilingi RNA di wilayah yang seragam. Bagian-bagian penyusunnya termasuk spike glikoprotein, amplop, nukleokapsid dan RNA masing-masing direpresentasikan sebagai M1, M2, M3, dan M4. Seperti yang dilaporkan oleh Centers for Disease Control and Prevention (CDC), COVID-19 adalah virus berukuran besar yang diameternya sekitar 120 nm. Oleh karena itu, diameter luar / dalam M1-M3 ditetapkan menjadi 120/100 nm, 100/80 nm, 60/50 nm, dan RNA (M4) berada dalam kisaran ruang berdiameter 50 nm.

Untuk formula molekuler dari setiap bagian penyusun dalam coronavirus novel, kita memilih dan menghitung urutan gen khas dari tiga jenis protein dan RNA pasien Wuhan dari Pusat Informasi Bioteknologi Nasional (NCBI). Urutan spike glikoprotein (M1) dari COVID-19 diambil dari Wuhan-Hu-1 (urutan referensi: NC 045512.2), [20] urutan amplop (M2), nukleokapsid (M3) dan RNA (M4) dipilih dari Wuhan-Hu-1 (GenBank: MN908947.3). Tabel 1 menunjukkan hasil statistik dari 20 urutan asam amino dari tiga jenis protein. Berat molekul rata-rata dari tiga jenis protein (protein lonjakan (M1), amplop (M2), nukleokapsid (M3)) masing-masing adalah 128,89, 131,19, dan 124,42. Rumus molekul rata-rata dari tiga jenis protein (protein lonjakan (M1), amplop (M2), nukleokapsid (M3)) adalah C4.9458H9.6732O2.4870N1.1987S0.0424, C5.2297H10.203O1.2523N2.3514S0.0360 dan C4.6108H9.2925O2.4505 N1.3042S0.0165.